Ректорат є колегіальним виконавчим органом, який здійснює поточне управління діяльністю Східноукраїнського національного університету імені Володимира Даля. Він підзвітний Вченій раді та засновнику, і відповідає за реалізацію освітньої, наукової, фінансово-господарської та кадрової політики університету.
Ректор: Ольга Вікторівна Поркуян
Виконує функції: Загальне керівництво діяльністю університету, представництво інтересів закладу у відносинах з державними органами, підприємствами та організаціями, а також підпис фінансових документів.
Перший проректор: Микола Миколайович Ковтун
Виконує функції: Заступництво ректора, координація роботи факультетів та інших структурних підрозділів.
Проректор з науково-педагогічної роботи: Сергій Юрійович Сергієнко
Виконує функції: Координація навчального процесу, розробка та впровадження освітніх програм, контроль якості викладання.
Проректор з наукової роботи: Андрій Володимирович Фомін
Виконує функції: Організація та управління науково-дослідною діяльністю, залучення фінансування для наукових проєктів, співпраця з науковими установами.
Проректор з адміністративно-господарської роботи: Олег Анатолійович Сафонов
Виконує функції: Забезпечення функціонування матеріально-технічної бази університету, контроль за станом будівель, приміщень та обладнання, організація ремонтних робіт.
Основними завданнями ректорату є:
Розробка та реалізація стратегії розвитку університету.
Забезпечення високої якості освіти та наукових досліджень.
Управління фінансово-господарською діяльністю та ефективне використання ресурсів.
Підтримка міжнародного співробітництва та інтеграція у світовий освітній простір.